Nació el 28 de agosto de 1870 en Jonacatepec, Morelos, y murió el 30 de marzo de 1954 en la ciudad de México. Ingresó a la Academia como miembro de número en 1952. Fue el 3° ocupante de la silla número XV.
En 1884 estudió en la Escuela Nacional Preparatoria. Posteriormente, cursó durante dos años Medicina, sin embargo, su verdadera vocación era la Ingeniería así que ingresó a la Escuela Nacional de Ingenieros, donde obtuvo los títulos de topógrafo e hidrógrafo. Asimismo, se graduó en Astronomía, Geografía, Geodesia, Minería y Mecánica.
Trabajó como oficial primero del Gran Registro de la Propiedad, donde se convirtió en ingeniero ayudante en la Comisión de Límites entre México y los Estados Unidos. Por otra parte, también se desenvolvió como político al ser diputado en el Congreso de la Unión durante diez años.
Asimismo, ejerció como profesor en la Escuela de Mecánica, en donde fue profesor de Mecánica y Cosmografía. También impartió clases en la Escuela Nacional de Ingenieros, en el Colegio Militar, en la de Agricultura y Veterinaria. Fue un asiduo estudioso, pues el conocimiento fue su pasión. De esta forma se afilió al positivismo, que se convirtió en su forma de vida, pese a críticas y oposiciones de importantes intelectuales del país.
Colaboró en el gobierno de Porfirio Díaz al apoyar la obra monumental llamada México y su evolución social. Fue presidente de la "Sociedad Científica Antonio Alzate", convertida en Academia Nacional de Ciencias. La obra de Agustín Aragón es numerosa. En ella se pueden encontrar: Examen de alguna de las consecuencias del cálculo de probabilidades bajo el punto de vista lógico (1893), Reflexiones acerca del criterio de Pièrre (1894), Los sofismas de algunos geólogos (1895), El estudio de las matemáticas desde el punto de vista educativo (1895), “Apreciación positiva de la lucha por la existencia”, en Memorias de la Sociedad Científica Antonio Alzate (1895), Cartas relativas a la lucha por la existencia (1896), “Las leyes penales desde el punto de vista filosófico”, enMemorias de la Sociedad Científica Antonio Alzate (1898), España y los Estados Unidos de Norteamérica. A propósito de la guerra. Disertaciones políticas. La guerra hispanoamericana (1898), “Necrología”, Émile Antonine, “Influencia social y moral de la lectura de novelas en la juventud”, “El Comité Occidental Positivista.”, “La inauguración de la estatua del Dr. Barreda en la ciudad de Puebla.”, “León XIII”, Revista Positiva, Científica, Filosófica, Social y Política (1901), “El nuevo sistema de lógica del Dr. Parra”, encomio publicado en El Diario delHogar, “Juárez: su obra y su tiempo, por Justo Sierra”, escrito laudatorio publicado en El Imparcial el 18 de abril de 1906, entre otras. Una gran parte de su obra está dispersa en la Revista Positiva. (Con información de Semblanzas de Académicos. Antiguas, recientes y nuevas de José Luis Martínez).
